加之鲜胚移植无需经过冷冻和解冻过程，减少了对受精卵的损伤风险。鲜胚移植也存在一些缺点。受制于需要等待56天进行培养，可能会延长整个辅助生殖周期的时间。再者在例外环境中可能会出现多个受精卵共时性地发育并形成多胞胎的情况，增加了早产和其他并发症的风险。冻胚移植是将多余的受精卵经过培养和冷冻保存，待需要时解冻并进行移植。这种方法的优势在于可以选择时间进行移植，增加了妊娠成功率。进一步说通过冷冻保存，可以将剩余的受精卵用于后续周期，提高了妊娠机会。
反之冻胚移植也存在一些问题。解冻过程可能会引发部分受精卵无法存活或发育异常。接续而言在特定情境中可能需要多次解冻才能选出合适的受精卵进行移植。另外肇始于需要进行培养和解冻过程，整个辅助生殖周期可能会更长。囊胚移植是指将受精卵在体外培养至囊胚阶段后再进行移植。这种方法相比鲜胚和冻胚移植更接近自然环境下的受孕过程。.对于一些不孕不育夫妇来说，囊胚移植可能是更好的选择。囊胚具有更高的发育潜力，可以提高妊娠成功率。
另一方面受制于囊胚已经发育到一定程度，可以减少多胞胎的风险。反之囊胚移植也存在一些限制。基于需要培养至囊胚阶段，整个辅助生殖周期可能会更长。